高覆盖率古基因组研究在一例清代中国多发性骨软骨瘤患者中发现EXT1基因的致病突变
High-coverage paleo-genome research identifies a pathogenic mutation on EXT1 in a Qing-period Chinese individual with multiple osteochondromas
多发性骨软骨瘤（MO）是一种罕见的骨骼疾病，其临床表现多样，在形态学和放射学上难以与表型相似的疾病相鉴别。作为一种与EXT1或EXT2基因突变相关的单基因疾病，古DNA分析可以为疑似病例提供基因确诊，并深入了解其发病机制。为了进一步研究一例先前报道的来自中国山东清代的疑似MO病例，我们对该患者的岩骨进行了古全外显子组测序，平均测序深度为27.172×。我们鉴定出EXT1配体结合位点Rossmann-2亚结构域的一个致病性杂合突变（c.791T>C；p.Leu264Pro），测序深度为17×，该突变也存在于一位无关的现代拉丁美洲患者中。此外，通过预测和分析EXT1蛋白的三维结构，我们检测到了结构和功能损伤。我们的研究结果拓展了已知的EXT1基因突变谱，并完善了罕见多发性骨髓瘤的基因型-表型图谱，从历史角度深入揭示了其遗传病理学。此外，这项研究从古病理学和古遗传学两个层面加深了我们对中国北方疾病分布的认识。
高覆盖率古基因组研究在一例清代中国多发性骨软骨瘤患者中发现EXT1基因的致病突变
High-coverage paleo-genome research identifies a pathogenic mutation on EXT1 in a Qing-period Chinese individual with multiple osteochondromas
中文摘要
多发性骨软骨瘤（MO）是一种罕见的骨骼疾病，其临床表现多样，在形态学和放射学上难以与表型相似的疾病相鉴别。作为一种与EXT1或EXT2基因突变相关的单基因疾病，古DNA分析可以为疑似病例提供基因确诊，并深入了解其发病机制。为了进一步研究一例先前报道的来自中国山东清代的疑似MO病例，我们对该患者的岩骨进行了古全外显子组测序，平均测序深度为27.172×。我们鉴定出EXT1配体结合位点Rossmann-2亚结构域的一个致病性杂合突变（c.791T>C；p.Leu264Pro），测序深度为17×，该突变也存在于一位无关的现代拉丁美洲患者中。此外，通过预测和分析EXT1蛋白的三维结构，我们检测到了结构和功能损伤。我们的研究结果拓展了已知的EXT1基因突变谱，并完善了罕见多发性骨髓瘤的基因型-表型图谱，从历史角度深入揭示了其遗传病理学。此外，这项研究从古病理学和古遗传学两个层面加深了我们对中国北方疾病分布的认识。