古DNA研究前沿

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智利与阿根廷印加卡帕克胡查祭仪的基因组及文化多样性

The Genomic and Cultural Diversity of the Inka Qhapaq Hucha Ceremony in Chile and Argentina

Constanza de la Fuente Castro · Genome Biology and Evolution

南美考古记录充分展现了古代人群社会文化的动态变化。古基因组分析发现区域内的基因流动，也为这一认识提供了支持。虽然这些信号的范围仍有待检验，不断增加的古基因组使研究者能够评估更细致的假说。本研究考察与印加卡帕克胡查祭仪有关个体的遗传多样性。在这一祭仪中，一名或多名个体被埋葬于安第斯山脉的山顶，并伴随印加及地方风格的供品，留下十分鲜明的考古记录。 我们利用古基因组学方法分析三名个体，包括本研究新获得的智利埃尔普洛莫山和阿根廷埃尔托罗山两份基因组，以及此前发表的阿根廷阿空加瓜山一份基因组。结果显示，每名个体具有不同的遗传亲近关系，呈现复杂的人口历史。 其中两名个体与印加帝国南部地区的现代及古代人群具有遗传相似性，第三名个体则可能经历过远距离迁徙。相似文化背景个体间的遗传多样性，支持印加在纳入新领土时采用高度多样化的策略。通过讨论区域人口流动的影响及其时间性，本研究进一步增进了对安第斯人口动态的认识。

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古基因组时间横断面揭示新石器时代黄河中游农民的人口动态

Ancient genomic time transect unravels the population dynamics of Neolithic middle Yellow River farmers

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拉斯戈巴斯的五个世纪的血缘关系、孤立、健康和冲突：北中世纪伊比利亚墓地

Five centuries of consanguinity, isolation, health, and conflict in Las Gobas: A Northern Medieval Iberian necropolis

Ricardo Rodríguez-Varela · Science Advances

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达尔马提亚晚期古代的生物考古学视角：赫瓦尔—拉多舍维奇墓地的古遗传学、饮食和人口研究

Bioarchaeological Perspectives on Late Antiquity in Dalmatia: Paleogenetic, Dietary, and Population Studies of the Hvar—Radošević burial site

Brina Zagorc · Archaeological and Anthropological Sciences

古代晚期达尔马提亚是罗马帝国政治动荡的时期，该地区居民的生活也因此受到影响。赫瓦尔-拉多塞维奇（Hvar – Radošević）古代晚期墓葬遗址位于克罗地亚达尔马提亚的赫瓦尔岛上，年代跨越公元3至5世纪。鉴于其时间框架和繁忙的海上贸易路线，对该墓葬遗址的研究使我们能够一窥岛上古代晚期居民的生活。该墓葬遗址共埋葬33人，其中17人葬于封闭的墓穴中，其余人则葬于墓穴附近的不同地点。本研究旨在通过研究祖先、人口结构、埋葬人群中可能存在的差异、饮食习惯和总体健康状况，为了解当时岛上居民的生活提供新的视角。对赫瓦尔-拉多塞维奇墓葬中埋葬人员祖先的基因分析揭示了一个多元化的群体，反映了当时的基因变异性。基因异常值的识别表明，该墓葬拥有来自罗马帝国不同地区的一系列血统，可能与古代赫瓦尔岛晚期古代港口的贸易路线有关。稳定同位素比值分析（δ13C 和 δ15N）表明，该墓葬的饮食主要以 C3 植物为主，极少食用海洋食物。较高的儿童死亡率、生理应激指标以及牙齿疾病表明该墓葬群体的生活质量较低。对亲属关系和饮食模式的评估显示，墓葬内外个体之间没有明显区别，这表明该特定墓葬群体中不存在基于社会地位和家族关系的差异性埋葬习俗。

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古DNA揭示法国南部新石器时代晚期集体墓葬的丧葬实践

Ancient DNA sheds light on the funerary practices of late Neolithic collective burial in southern France

Ana Arzelier · Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences

法国南部加尔省科尔孔的阿旺德拉布克勒是一处喀斯特竖井，在校正后的公元前3600至2800年间被用作集体墓地。遗址包含约75名个体的骨骼遗骸，以成年人为绝大多数，骨骼呈分散且相互混杂的状态。此前，利用古DNA研究新石器时代集体墓葬的工作仍然较少，这类结构中的丧葬选择规则也存在较大争议。 本研究将37名个体的基因组分析，与考古人类学资料及放射性碳年代的贝叶斯模型相结合，以辨认死者身份及相互关系，并厘清这一社群的遗传多样性与丧葬动态。基因组结果显示，76%的新石器时代个体为男性，提示存在明显的性别偏向选择。 现有资料凸显了生物学亲缘关系及经男性传递社会地位的重要性：是否属于特定父系谱系，似乎是决定进入墓地的主要因素。尽管陶器材料反映出文化变化，基因组结果仍支持同一社群在公元前3600至2800年间持续将死者安置于此。

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新兴精英在罗马帝国崩溃后社群形成与发展中的作用

The role of emerging elites in the formation and development of communities after the fall of the Roman Empire

Yijie Tian · Proceedings of the National Academy of Sciences

中世纪早期，精英在后罗马欧洲的形成过程中发挥了宏观与微观层面的关键作用。历史学和考古学长期依靠文献及考古记录描述和辨认这些精英。本研究综合古基因组、考古及同位素数据，从不同角度探讨公元6至8世纪意大利科莱尼奥附近一处伦巴第时期社群中精英群体的作用。 我们将新测序的28份基因组与此前发表的24份基因组相结合，并纳入锶、碳和氮同位素测量。结果显示，这一社群由一张同时具有生物学和社会联系的人际网络建立，并围绕该网络组织。这一网络可能由多个精英家庭构成，随后逐渐发展为一个扩展家系。社群也包含具有不同遗传祖源的个体，并在其后期通过吸纳新来者和其他群体维持多样性。 研究揭示了西罗马帝国解体及新王国兴起之后，政治权力变化和人口迁徙如何影响其原有核心区域内一个小型乡村社群的形成与发展。结果进一步提示，中世纪早期精英能够吸纳不同背景的个体，他们的形成体现了政治行动与选择，而不是源于生物学上同质的人群。

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墨西哥奇瓦瓦州帕基梅一名儿童的高度近亲婚配证据

High levels of consanguinity in a child from Paquimé, Chihuahua, Mexico

Jakob Sedig · Antiquity

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法国西北地区的人类遗传结构为西欧历史人口学提供了新的见解.

Human genetic structure in Northwest France provides new insights into West European historical demography

Isabel Alves · Nature Communications

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黄河下游大汶口文化的新石器时代与中原地区的人口扩散有关

Neolithization of Dawenkou culture in the lower Yellow River involved the demic diffusion from the Central Plain

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对骨骼遗骸的多代理生物考古学分析表明中世纪西西里社区存在遗传不连续性

Multi-proxy bioarchaeological analysis of skeletal remains shows genetic discontinuity in a Medieval Sicilian community

Aurore Monnereau · Royal Society Open Science

背景 伊斯兰对伊比利亚半岛的影响在文化和语言上留下了持久的遗产，但其人口影响尚不明确。本研究旨在通过古代 DNA 探索中世纪早期至晚期伊比利亚东部基因流动和人口结构的动态。 结果 我们全面的基因组分析揭示了伊斯兰时期之前从地中海各个地区流入伊比利亚的基因流动，支持了罗马帝国时期存在的泛地中海同质化现象。北非血统在古代晚期基因组中存在但零星，但在伊斯兰时期得到巩固。我们发现了西班牙最早的伊斯兰墓葬之一，显示出高度的近亲繁殖。我们还首次证明了北非血统在基督教墓地中一直存在到 17 世纪，此外还有来自马格里布的奴隶贩运证据。 结论 本研究揭示了影响伊比利亚东部人口的政治事件和文化变迁之间的复杂相互作用。它强调了奴隶贸易的存在，并强调了历史事件（如公元 1609 年驱逐摩尔人事件）通过大规模人口迁移和更替对该地区遗传和文化景观的持久影响。

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古基因组为了解中国西南地区历史时期的遗传历史提供了见解

Ancient genomes provide insights into the genetic history in the historical era of southwest China

Fan Zhang · Archaeological and Anthropological Sciences

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古代基因组揭示中国中原地区的长期遗传稳定性

Ancient genomes shed light on the long-term genetic stability in the Central Plain of China

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中国南北朝时期一名世袭精英的古基因组分析

Ancient genomic analysis of a Chinese hereditary elite from the Northern and Southern Dynasties

Yao Yu · Journal of Genetics and Genomics

中国南北朝时期是北方族群融合的重要阶段。然而，既往古DNA研究主要关注北方族群，对世袭精英家族遗传形成的研究相对有限，尽管这类群体具有丰富的考古记录和清晰的物质文化身份。本研究获得了世袭精英高宾（公元503至572年）的古基因组，覆盖度为0.6473倍，在1240k位点面板上包含475132个单核苷酸多态性位点。 高宾的线粒体单倍群为Z4，Y染色体单倍群为O1a1a2b-F2444*。他的遗传特征与北方汉族最为相似。祖源模型可将其全部祖源解释为来自新石器时代晚期至铁器时代的黄河农耕人群，无需引入东北亚、朝鲜半岛或蒙古高原相关祖源。 本研究为认识南北朝族群融合背景下世袭精英家族的遗传形成提供了新的证据。

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古代基因组阐明了黄河中下游的空间遗传连续性 & 古基因组揭示山东省过去两千年的人口历史

Ancient genomes illuminate the demographic history of Shandong over the past two millennia

Qu Shen · Journal of Genetics and Genomics

山东省位于黄河下游，是中国古代文明的发祥地之一。然而，由于缺乏古人类基因组，该地区完整的遗传历史至今仍鲜为人知。本文，我们展示了21个来自山东的古代基因组，其年代可追溯至战国至北朝时期。与山东早期新石器时代样本不同，这些历史样本与黄河中游流域晚期新石器时代后人群的亲缘关系最为密切，这表明山东地区从新石器时代到历史时期存在一次人口更替。此外，我们还检测到山东历史样本与当代汉族之间存在密切的遗传亲缘关系，表明至少自战国时期以来，汉族人群的遗传基因一直保持长期稳定性。

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六代新石器时代农民反复感染瘟疫

Repeated plague infections across six generations of Neolithic Farmers

Frederik Valeur Seersholm · Nature

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从古基因组推断广西洞葬人群与苗瑶人群的遗传亲缘关系

Genetic affinity of cave burial and Hmong-Mien populations in Guangxi inferred from ancient genomes

Jianxin Guo · Archaeological and Anthropological Sciences

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新石器时代晚期集体掩埋揭示了第三个千年期间的混合动力,以及欧洲基因组的形成

Late Neolithic collective burial reveals admixture dynamics during the third millennium BCE and the shaping of the European genome

Oğuzhan Parasayan · Science Advances

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瑞士科尔诺/莱索日铁器时代桥梁的地理起源、祖先和死亡情况

Geographic origin, ancestry, and death circumstances at the Cornaux/Les Sauges Iron Age bridge, Switzerland

Zita Laffranchi · Scientific Reports