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Genome-wide ancient DNA data from two 7,000-year-old individuals from Takarkori Rockshelter in Libya, and Archaic admixture capture data from seven 15,000-year-old individuals from Taforalt Cave, Morocco.

Ancient DNA from the Green Sahara reveals ancestral North African lineage

绿色撒哈拉的古代 DNA 揭示了祖先北非血统 来自利比亚塔卡科里岩棚的两个 7,000 年前个体的全基因组古代 DNA 数据，以及来自摩洛哥塔福拉尔特洞穴的七个 15,000 年前个体的古代混合捕获数据。

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近东血统抵达意大利中部的时间早于罗马帝国的兴起

The arrival of the Near Eastern ancestry in Central Italy predates the onset of the Roman Empire

意大利的遗传史深受罗马人的影响。虽然铁器时代与当代欧洲地区相当，但意大利中部的基因库在帝国时代受到了近东血统的重大影响。为了解释这种转变，有人提出，在此期间，来自帝国东地中海地区的人们向其政治中心迁移。在本研究中，通过分析一个新个体 (1.25 倍) 和已发表的共和样本，我们提出了一种新的视角来解释近东血统在帝国基因库中的存在。在我们的设想中，这种遗传血统的传播发生在共和时期后期，比帝国的开始早了约 200 年。这种血统的传播可能是由于早期东西方运动而发生的，因为东地中海地区在共和国时期已经受到罗马政治影响，甚至可能是由于希腊人和腓尼基人定居的意大利南部的移民。

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伊比利亚半岛东部的中世纪基因组阐明了摩尔人大规模驱逐在拆除与北非的长期遗传桥梁方面所起的作用

Medieval genomes from eastern Iberia illuminate the role of Morisco mass deportations in dismantling a long-standing genetic bridge with North Africa

17 世纪初，一场残酷的种族清洗直接导致伊比利亚东部边缘地区的人口更替。在菲利普三世统治下，至少有 30 万摩尔人被驱逐到北非。这些人大多是伊比利亚和北非混血血统，已在伊比利亚定居数百年，一个世纪前被迫从伊斯兰教改信天主教。尽管欧洲文化中留下了巨大的文明遗产，并一直延续至今，但西班牙的“摩尔人”在公元 1609 年至 1614 年间大部分被赶出了伊比利亚。结果，欧洲和非洲之间形成的、几个世纪以来一直存在的遗传桥梁最终被切断。在这项研究中，我们使用从古代晚期到中世纪后时期的现代西班牙巴伦西亚地区的基因组时间横断面研究了这一历史事件的遗传意义。

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揭秘现今塞尔维亚莱彭斯基维尔新生儿墓葬背后的故事

Unveiling the narrative behind the neonate burials at Lepenski Vir in present-day Serbia

多瑙河峡谷地区的 Lepenski Vir 是一个中石器时代和新石器时代的定居点，以艺术砂岩巨石而闻名，这些巨石通常与中石器时代-新石器时代转型阶段的梯形房屋遗迹有关。此外，新生儿的墓葬被切入这些建筑物的红色灰泥地板，但原因尚不清楚。我们制作了四个个体的古基因组——两个新生儿被发现在梯形房屋的地板下，一个成年人和一个婴儿被埋在一个相邻的坑里。我们的目的是推断他们之间的遗传相关性，以了解新生儿的身份以及他们为什么被埋在与房屋相关的地方，以及这些独特房屋的功能是什么。基因结果表明，两个新生儿既有爱琴海/安纳托利亚血统，也有铁门狩猎采集者的血统，而且建筑物中也有混血个体。相比之下，在坑中发现的个体完全有爱琴海/安纳托利亚血统。由于没有发现任何生物相关性，因此可以假设这些房屋并非作为居住场所。其中一个可能的解释是，它们服务于社区——作为生育场所或社区进行社交和仪式活动的场所，这一点可以从地板上方发现的象征性文物和艺术品中看出。结果表明，多瑙河峡谷存在着强大的社会关系，这将促进社会文化互动和生物融合，为早期农民和当地觅食者带来好处，逐渐导致社会和人口变化。

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Inequality at the Dawn of the Bronze Age: The Case of Başur Höyük, a ‘Royal’ Cemetery at the Margins of the Mesopotamian World

An investigation into the Early Bronze Age cemetery of Başur Höyük.

对巴苏尔霍裕克（Başur Höyük）早期青铜时代墓地的调查。 在底格里斯河和幼发拉底河的上游，考古学家发现了一些证据，这些证据挑战了人们对早期国家形成的传统理解，即从“小规模、平等”社会向“大规模、分层”社会的过渡。其中一个地方是青铜时代早期的巴苏尔霍裕克墓地，它提供了盛大的葬礼仪式的证据——包括“家臣墓葬”和壮观的金属财富沉积——在一个原本规模较小、平等的环境中。这座墓地的另一个令人费解的特点是，最富有的墓葬中以青少年为主。在这里，我们描述了巴苏尔霍裕克考古学和人类学分析的综合结果，包括古代 DNA，并考虑了它们对早期国家形成的传统说法提出的挑战。

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从扎滚鲁克遗址古基因组推断铁器时代新疆的人口动态

Population dynamics in Iron Age Xinjiang inferred from ancient genomes of the Zhagunluke site

南疆铁器时代的扎滚鲁克文化与周边地区文化联系密切，农耕与畜牧并存，被认为是古代且末王国的代表。但古代且末王国的人口历史细节以及文化交流是否伴随着人口迁移仍不清楚。本研究报告了扎滚鲁克一号墓地中两个个体的古基因组。结合已发表的古基因组数据，我们观察到扎滚鲁克人中东西方混合模式，不同血统的比例不同，与扎滚鲁克遗址的多元文化元素相对应。此外，我们还发现了一个遗传异常值，其主要血统与黄河或西辽河流域的粟农有关，这表明有来自中国北方的移民进入南疆。我们的研究结果表明，人群相互作用显著影响了扎滚鲁克人群的遗传特征。

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古代基因组揭示了欧洲匈奴与匈奴帝国之间的跨欧亚联系

Ancient Genomes reveal trans-Eurasian connection between European Huns and the Xiongnu Empire

匈奴于公元 370 年代出现在欧洲，建立了一个重塑西欧亚历史的帝国。然而，直到今天，他们的起源仍是一个备受争议的问题。传统理论认为他们与匈奴有关，后者是蒙古草原第一个游牧帝国的创始人。然而，匈奴帝国在匈奴出现在欧洲前约 300 年就解体了，而且在这段时间里，几乎没有关于匈奴人在草原的考古和历史证据。此外，尽管喀尔巴阡盆地拥有丰富的 5 至 6 世纪考古记录，但与草原有关的文化元素仅限于少数发现，甚至更少的东方式孤墓。在本研究中，我们联合分析了考古学证据和 34 个新测序和已发表的基因组数据，共涉及 369 个人 - 来自喀尔巴阡盆地的 5 至 6 世纪背景，包括九个匈奴时期的东方类型墓葬、中亚各地的 2 至 5 世纪遗址和蒙古草原各地的公元前 2 至 1 世纪匈奴时期遗址。我们没有发现在匈奴时期和后匈奴时期喀尔巴阡盆地人口中存在大量东方/草原后裔社区的证据。我们还观察到东方类型墓葬中存在高度遗传多样性，这重现了整个欧亚草原观察到的变异性。这表明即将到来的草原征服者的起源是混合的。尽管如此，长期共享的基因组片段提供了令人信服的证据，证明遗传谱系直接将匈奴时期一些最精英的个体与一些草原征服者及其后代联系起来，表明一些欧洲匈奴人是他们的后裔。

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对数百名哈萨克人进行全基因组测序和分析

WGS and analysis of hundreds Kazakh individuals

哈萨克斯坦是世界第九大国，位于丝绸之路沿线，连接欧亚大陆。历史上，其领土曾是游牧部落的家园，如今的哈萨克斯坦是一个多民族国家，以哈萨克族为主。我们利用新一代测序平台，对数百名哈萨克斯坦人的基因组进行了高覆盖度测序和分析。我们分析并注释了这一高质量的大型全基因组数据集，旨在建立一个代表中亚地区哈萨克斯坦人群的全国性基因组数据库。这些健康哈萨克斯坦人的全基因组序列数据，有望为常见疾病的生物医学研究做出重要贡献，因为其研究结果有助于更深入地了解群体层面的基因型-表型关系。

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古代线粒体基因组揭示了新石器时代晚期中国中原地区人群与母系遗传多样性的相互作用

Ancient mitogenomes reveals population interactions with high maternal genetic diversity in the Central Plains of China during the late Neolithic period

中原地区是中国最早的粟、黍驯化中心之一，孕育了丰富的考古学文化，在新石器时代与周边人群有着广泛的互动。然而，有限的基因组研究阻碍了人们对这一时期母系遗传结构和人口扩张历史的清晰认识。本文报告了来自河南龙山文化时期阎寨遗址人群的12个完整线粒体基因组，揭示了较高的母系遗传多样性。这些个体与黄河流域古代人群的遗传距离较近，凸显了自新石器时代晚期以来的母系遗传连续性。此外，我们的研究还揭示了由各种因素驱动的多次人口扩张事件，这些事件可能对现代东亚人群的遗传组成有所贡献。总之，我们的研究为中原地区新石器时代晚期的遗传起源和人口动态提供了一个新的视角。

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从新石器时代到青铜时代的北庞蒂克地区基因组历史

A genomic history of the North Pontic Region from the Neolithic to the Bronze Age

北庞蒂克地区是古欧洲农民与欧亚草原采集者和游牧民的交汇点1,2，也是深入欧洲的移民源头3,4,5。本文我们报告了 81 名史前北庞蒂克个体的全基因组数据，以了解该地区人民的基因构成。北庞蒂克采集者的祖先有巴尔干和东方狩猎采集者6，也有欧洲农民，偶尔还有高加索狩猎采集者的血统。在铜石并用时代，一波来自高加索-伏尔加河下游地区7的移民绕过当地的采集者，与特里皮利乌斯农民平等混合，形成了公元前 4500 年左右的乌萨托夫文化人群。一波时间上重叠的来自高加索-伏尔加河下游的移民与采集者混合，而不是与农民混合，形成了塞雷德尼斯蒂人7。第三波是颜那亚人——他们是塞雷德尼·斯蒂赫人的后裔，约公元前4000年由混血形成，并在青铜时代早期（公元前3300年）扩张。塞雷德尼·斯蒂赫人和颜那亚人之间的时间差距由一位来自乌克兰米哈伊利夫卡（公元前3635-3383年）的颜那亚人填补。米哈伊利夫卡是铜石时代向青铜时代过渡时期考古学上的连续性遗址，很可能是颜那亚人形成的中心。这三波迁徙浪潮都传承了独特的血统，同时也吸纳了外来者，这种灵活的策略或许可以解释北庞蒂克民族为何能够成功地将其基因和文化传播到欧亚大陆。

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过去 6000 年来，北部沿海人群充当了东亚基因流动的桥梁

East Asian Gene flow bridged by northern coastal populations over past 6000 years

山东地区的东北亚沿海地区在过去 10,000 年中经历了复杂的文化变迁，促进了东亚大陆内陆地区与日本列岛等岛屿之间的人口互动。为了研究山东人口如何随时间变化并与岛屿和内陆东亚人口互动，我们对山东地区 11 个古代遗址的 85 个个体进行了测序，这些遗址的历史可以追溯到约 6000-1500 年前。我们发现，与山东人口相关的血统可能解释了日本列岛弥生时代后人群中观察到的大陆东亚血统，尤其是约 2800 年前后居住在琉球群岛的近期人群。在山东地区，我们观察到至少约 7700 年前该地区的北部和南部人群的基因流动，以及在大汶口文化时期（6000-4600 BP）和早王朝时期（3500-1500 BP）与内陆黄河人群相关的两波基因流动进入山东地区。重建东亚北部沿海地区新石器时代、青铜时代和铁器时代人群的遗传历史，显示了南北和东西（内陆-沿海-岛屿）尺度上的基因流动。

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从新石器时代晚期至铁器时代古人类基因组推断中原和海岱地区的动态历史

Dynamic history of the Central Plain and Haidai region inferred from late Neolithic to Iron Age ancient human genomes

由于古代基因组数量有限，黄河流域 (YR) 的人口历史仍未被充分探索。我们的研究通过联合分析先前发表的基因组和 31 个新生成的晚期新石器时代至铁器时代的基因组，揭示了黄河流域的人口动态历史，这些基因组来自黄河流域下游的山东和黄河流域中部的中原地区。我们的分析揭示了新石器时代晚期龙山文化时期山东和中原地区的人口结构。我们提供了一个遗传学上的平行数据，以证明龙山时期中、下游的稻作农业显著增加。然而，龙山时期与稻作农民相关的基因流并没有从中原的禹庄遗址或先前发表的山东群体中成群出现。青铜时代的二里头文化基因组验证了中原地区的遗传稳定性以及中原地区和山东之间的相对遗传同质性。

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英格兰多塞特郡后罗马遗址沃斯马特拉弗斯的 DNA

Dna from post-roman site worth matravers in dorest england

在考古记录中，亲属关系的证据可能很难辨别。在这里，我们使用古代 DNA 来研究多塞特郡沃斯马特拉弗斯后罗马时期遗址的生物相关性和可能的​​亲属关系。我们发现，生物亲属和社会亲属关系都与埋葬模式有关，但生物亲属关系几乎完全与母系血统有关。虽然大多数人都有当地的英国血统，但有些人带有欧洲大陆的血统，而一名按照当地习俗埋葬的年轻男性则带有近期西非血统，这凸显了中世纪早期英国的多元文化遗产。

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铁器时代英国的大陆移民涌入和母系居住现象

Continental influx and pervasive matrilocality in Iron Age Britain

我们在这里分析了来自杜罗特里格墓葬遗址的 57 个古代基因组，发现了一个以单一母系为中心的扩大亲属群体，无关的（可能是向内迁移的）墓葬主要以男性为主。

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尽管存在共同的阿瓦尔时期文化，古代 DNA 仍揭示出生殖障碍

Ancient DNA reveals reproductive barrier despite shared Avar-period culture

722 个个体的古代基因组数据以及维也纳南部（奥地利）邻近大型公元七至八世纪墓地的细粒度跨学科分析

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巴黎盆地（法国）新石器时代早期和中期人类的古遗传学研究

Paleogenetic study of Early and Middle Neolithic humans from the Paris Basin (France)

在这里，我们提供了来自巴黎盆地（法国）人类样本的古基因组数据。这些个体可以追溯到早期（公元前 5100 年 - 公元前 4800 年）和中新石器时代（公元前 4800 年 - 公元前 4000 年）。它们被发现于 7 个不同的考古遗址：Balloy-les-Réaudins、Gron-les-Sablons、Marolles-sur-Seine（lesCarrières-et les-Taupes）、Orville-les-Fiefs、Passy-la-Sablonnière、Vignely-la-Porte-aux-bergers。中新石器时代样本属于 Cerny 年代文化背景。

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揭秘粟特人的起源：古代中亚与东亚人基因混合的证据

Unraveling the Origins of the Sogdians: Evidence of Genetic Admixture between Ancient Central and East Asians

丝绸之路是一条连接中国与西方的古代贸易路线，促进了不同文明之间的商品、思想和文化习俗交流。粟特人是丝绸之路沿线的著名商人，以商人、工匠和艺人的角色而闻名。他们移居中国，形成了持久的社区，并繁衍了多代后代。尽管粟特人具有历史重要性，但关于其起源及其与当地人口互动的主要书面记录却非常有限。在这项研究中，我们为来自固原墓地唐代（公元 618-907 年）联合墓葬（M1401）的两个古代个体生成了全基因组数据。据我们所知，这是从粟特人群中获得的第一个古代基因组数据。我们的结果表明，女性个体表现出当地血统，而男性则携带当地血统和与中亚巴克特里亚-马尔吉亚纳考古群 (BMAC) 相关的其他遗传成分。这大约在 18 代前被引入当地基因库。结合历史、考古和遗传分析，我们得出结论，这两个人可能是夫妻。我们的研究结果表明，粟特人最初前往中国进行贸易，定居下来，与当地居民通婚，并在丝绸之路贸易中扮演了重要的中间人角色。这项研究强调了公元前一千年末粟特人在促进希腊化世界与秦汉王朝之间的联系方面的重要性，强调了早期粟特人的身份特征，这些特征先于他们后来成为丝绸之路的主要商人。

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波哥大高原长达 6000 年的基因组横断面揭示了哥伦比亚人口历史中的多次基因转变

A 6,000-year-long genomic transect from the Bogotá Altiplano reveals multiple genetic shifts in the demographic history of Colombia

对美洲原住民的遗传学研究彻底改变了我们对美洲人口历史的理解。然而，迄今为止尚未通过古代基因组学研究过的地区是哥伦比亚，它是进入南美洲的入口。在这里，我们报告了 6,000 至 500 年前哥伦比亚波哥大高原 21 名个体的全基因组数据。我们发现，陶器时代之前的狩猎采集者代表了一种以前未知的、源自最初南美辐射的基底谱系。这些狩猎采集者与古代北美群体没有差异亲和力，也没有在遗传上对古代或现在的南美人群做出贡献。到 2,000 年前，当地血统被与埃雷拉陶器群有关的中美洲人群所取代，尽管发生了重大的文化变革，但仍然在穆伊斯卡时期幸存下来。这些古老的高原个体与来自地峡的奇布查语使用者表现出比与哥伦比亚土著人更高的亲和力，这表明在随后的分散事件中，奇布查语相关血统的血统被稀释了。

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