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古DNA论文
阿什肯纳兹利未人Y染色体中R1a分支的遗传变异
The genetic variation in the R1a clade among the Ashkenazi Levites’ Y chromosome
全球约有30万男性自认为是阿什肯纳兹利未人，其中三分之二此前已被证实源自同一位男性。由于缺乏完整的Y染色体序列，无法确定这位祖先的年龄、地理起源和迁徙模式。本文报告了486条Y染色体的变异情况，这些变异包括阿什肯纳兹利未人和非阿什肯纳兹利未人R1a分支、其他阿什肯纳兹犹太父系谱系，以及非利未犹太人和非犹太人R1a样本。总体而言，我们初步构建了一个祖先的谱系图谱，该祖先来自中东，自认为是利未人，并携带高度解析的R1a-Y2619谱系，该谱系很可能是希伯来人中的一个次要单倍群。星状系统发育树，与其他阿什肯纳兹父系谱系相似地聚合，距今约 1743 年，表明它是阿什肯纳兹父系创始人之一；作为阿什肯纳兹人口整体扩张的一部分而扩张，与利未人血统没有特殊关系；随后传播到非阿什肯纳兹利未人。
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阿什肯纳兹利未人Y染色体中R1a分支的遗传变异
The genetic variation in the R1a clade among the Ashkenazi Levites’ Y chromosome
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全球约有30万男性自认为是阿什肯纳兹利未人，其中三分之二此前已被证实源自同一位男性。由于缺乏完整的Y染色体序列，无法确定这位祖先的年龄、地理起源和迁徙模式。本文报告了486条Y染色体的变异情况，这些变异包括阿什肯纳兹利未人和非阿什肯纳兹利未人R1a分支、其他阿什肯纳兹犹太父系谱系，以及非利未犹太人和非犹太人R1a样本。总体而言，我们初步构建了一个祖先的谱系图谱，该祖先来自中东，自认为是利未人，并携带高度解析的R1a-Y2619谱系，该谱系很可能是希伯来人中的一个次要单倍群。星状系统发育树，与其他阿什肯纳兹父系谱系相似地聚合，距今约 1743 年，表明它是阿什肯纳兹父系创始人之一；作为阿什肯纳兹人口整体扩张的一部分而扩张，与利未人血统没有特殊关系；随后传播到非阿什肯纳兹利未人。
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古DNA论文
古埃及木乃伊基因组表明后罗马时期撒哈拉以南非洲血统有所增加
Ancient Egyptian mummy genomes suggest an increase of Sub-Saharan African ancestry in post-Roman periods
埃及位于非洲地峡，因其地理位置优越，且有文献记载其与非洲、亚洲和欧洲古代文明的互动，是研究历史人口动态的理想地区。尤其是在公元前一千年，埃及遭受了外国统治，导致越来越多的外国人在其境内生活，这可能对当地人口的遗传构成了贡献。本文展示了从埃及木乃伊中提取的90个线粒体基因组以及来自三个个体的全基因组数据集。从中埃及发现的样本涵盖了从新王国时期到罗马时期约1300年的古埃及历史。我们的分析表明，与现代埃及人相比，古埃及人与近东人拥有更多的共同祖先，而现代埃及人在近代又融合了撒哈拉以南地区的基因。这项分析确立了古埃及木乃伊作为研究古人类历史的遗传来源的地位，并提供了从全基因组层面解读埃及历史的视角。
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古DNA论文
古埃及木乃伊基因组表明后罗马时期撒哈拉以南非洲血统有所增加
Ancient Egyptian mummy genomes suggest an increase of Sub-Saharan African ancestry in post-Roman periods
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埃及位于非洲地峡，因其地理位置优越，且有文献记载其与非洲、亚洲和欧洲古代文明的互动，是研究历史人口动态的理想地区。尤其是在公元前一千年，埃及遭受了外国统治，导致越来越多的外国人在其境内生活，这可能对当地人口的遗传构成了贡献。本文展示了从埃及木乃伊中提取的90个线粒体基因组以及来自三个个体的全基因组数据集。从中埃及发现的样本涵盖了从新王国时期到罗马时期约1300年的古埃及历史。我们的分析表明，与现代埃及人相比，古埃及人与近东人拥有更多的共同祖先，而现代埃及人在近代又融合了撒哈拉以南地区的基因。这项分析确立了古埃及木乃伊作为研究古人类历史的遗传来源的地位，并提供了从全基因组层面解读埃及历史的视角。
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古DNA论文
南亚人极低覆盖率的全基因组测序捕获了群体基因组学信息
Extremely low-coverage whole genome sequencing in South Asians captures population genomics information
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南亚人极低覆盖率的全基因组测序捕获了群体基因组学信息
Extremely low-coverage whole genome sequencing in South Asians captures population genomics information
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两名新石器时代早期东亚人的全基因组数据，可追溯至 7700 年前
Genome-wide data from two early Neolithic East Asian individuals dating to 7700 years ago
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两名新石器时代早期东亚人的全基因组数据，可追溯至 7700 年前
Genome-wide data from two early Neolithic East Asian individuals dating to 7700 years ago
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古DNA论文
辽宁省汉族人群线粒体DNA多态性特征
Characterization of mitochondrial DNA polymorphisms in the Han population in Liaoning Province，Northeast China
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辽宁省汉族人群线粒体DNA多态性特征
Characterization of mitochondrial DNA polymorphisms in the Han population in Liaoning Province，Northeast China
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古DNA论文
重建西伯利亚和东北欧人群的遗传史
Reconstructing genetic history of Siberian and Northeastern European populations
西伯利亚和俄罗斯西北部是40多个文化和语言各异的土著民族的家园，然而，该地区人群的遗传变异和历史却鲜为人知。我们对来自该地区14个不同土著群体的28名个体进行了深度全基因组测序（约38倍）。我们将这些数据与另外32个现代人和46个古代人类的基因组相结合，重建了几个北欧亚土著人群的遗传历史。我们发现，西伯利亚和东亚人群与一位4.5万年前的乌斯季伊希姆（Ust’-Ishim）个体拥有38%的共同祖先，而此前人们认为这位个体没有现代后裔。西伯利亚西部人群则有57%的祖先可以追溯到古代北欧亚人，其代表人物是2.4万年前的西伯利亚马尔塔（Mal'ta）男孩MA-1。东西伯利亚人群形成了一个独特的亚谱系，大约在1万年前与其他东亚人群分离。此外，我们还发现了西伯利亚人与来自萨马拉、卡累利阿、匈牙利和瑞典的东欧狩猎采集者（距今8000-6600年）、亚姆纳亚人（距今5300-4700年）以及现代东北欧人的基因混合。我们的研究结果为西伯利亚和东北欧人群的遗传历史提供了新的见解，并证实了古代基因从西伯利亚流入欧洲。
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重建西伯利亚和东北欧人群的遗传史
Reconstructing genetic history of Siberian and Northeastern European populations
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西伯利亚和俄罗斯西北部是40多个文化和语言各异的土著民族的家园，然而，该地区人群的遗传变异和历史却鲜为人知。我们对来自该地区14个不同土著群体的28名个体进行了深度全基因组测序（约38倍）。我们将这些数据与另外32个现代人和46个古代人类的基因组相结合，重建了几个北欧亚土著人群的遗传历史。我们发现，西伯利亚和东亚人群与一位4.5万年前的乌斯季伊希姆（Ust’-Ishim）个体拥有38%的共同祖先，而此前人们认为这位个体没有现代后裔。西伯利亚西部人群则有57%的祖先可以追溯到古代北欧亚人，其代表人物是2.4万年前的西伯利亚马尔塔（Mal'ta）男孩MA-1。东西伯利亚人群形成了一个独特的亚谱系，大约在1万年前与其他东亚人群分离。此外，我们还发现了西伯利亚人与来自萨马拉、卡累利阿、匈牙利和瑞典的东欧狩猎采集者（距今8000-6600年）、亚姆纳亚人（距今5300-4700年）以及现代东北欧人的基因混合。我们的研究结果为西伯利亚和东北欧人群的遗传历史提供了新的见解，并证实了古代基因从西伯利亚流入欧洲。
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古DNA论文
喜马拉雅弧高谷地区的人们具有长期的遗传稳定性和高海拔的东亚起源 - 更新中
Long-term genetic stability and a high-altitude East Asian origin for the peoples of the high valleys of the Himalayan arc
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喜马拉雅弧高谷地区的人们具有长期的遗传稳定性和高海拔的东亚起源 - 更新中
Long-term genetic stability and a high-altitude East Asian origin for the peoples of the high valleys of the Himalayan arc
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古DNA论文
Y 染色体树长出叶子：13,000 个高置信度 SNP，涵盖大多数已知进化枝
The Y-chromosome tree bursts into leaf: 13,000 high-confidence SNPs covering the majority of known clades
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Y 染色体树长出叶子：13,000 个高置信度 SNP，涵盖大多数已知进化枝
The Y-chromosome tree bursts into leaf: 13,000 high-confidence SNPs covering the majority of known clades
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古DNA论文
夏尔巴人的线粒体DNA谱系扩展表明西藏高原的适应性进化
mtDNA Lineage Expansions in Sherpa Population Suggest Adaptive Evolution in Tibetan Highlands
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夏尔巴人的线粒体DNA谱系扩展表明西藏高原的适应性进化
mtDNA Lineage Expansions in Sherpa Population Suggest Adaptive Evolution in Tibetan Highlands
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